达成理想的大结局，其核心并非追求单一的最佳，而是通过一系列决定因素决策和充分准备，引导故事走给壹个对主角V而言相对圆满的收束。达成这些大结局需要玩家在游戏经过中有觉悟地完成特定人物的全部支线任务，并和强尼·银手建立良好的关系，这些是解开最终选择权的基础。和帕南、罗格等人物的深入互动所建立的联盟，将直接转化为最终决战时的助力，从而开辟不同的大结局途径。专注于这些支线剧情是规划大结局走给的首要流程。

游戏提供了数个常被玩家视为较优选择的大结局，其中星星大结局标准玩家完成流浪者帕南的全部支线任务并和阿德卡多部族结盟。在最终任务夜曲OP.55N.1中，跟随米丝蒂来到天台和强尼·银手对话时，需要选择给帕南求助，此后阿德卡多部落将协助进攻荒坂塔。成功击败亚当·重锤并进入赛博空间后，在决定因素对话中选择想好好度过剩余的生活，并从井中回到自己的身体，即可触发和流浪者一起离开夜之城的大结局。

另壹个重要大结局是太阳大结局，达成此大结局需要完成来生酒吧上一任女王罗格的全部支线任务。同样在最终任务的天台对话中，玩家需要选择相信强尼和罗格，让罗格协助行动。在后续的赛博空间里面临最终抉择时，选择回到自己的身体，即可触发V成为夜之城传奇、接管来生酒吧的大结局。此大结局和星星大结局在赛博空间内的最终选择逻辑是一致的，不同差异在于前期求助的盟友不同。

游戏还存在壹个挑战性极高的隐藏大结局。触发该大结局的前提是在支线任务插管中，通过一系列特定对话选项将强尼·银手的好感度提高至足够高的水平。在最终天台和强尼对话时，玩家需要保持沉默并等待大约五分钟，之后便会解开独自进攻荒坂塔的选项。选择此途径将面临极高难度的战斗，但成功后进入赛博空间，仍然可以自主选择是将身体交还V还是留给强尼，从而走给不同的大结局分支。

为了确保能顺利完成最终的高强度战斗，无论选择哪条大结局途径，充分的战前准备都至关重要。玩家需要合理分配人物的属性点和技能点，以构建有效的战斗流派。积极收集并更新强力的传说级武器和义体，能够显著降低最终战斗的难度。尤其对于选择隐藏大结局独自行动的玩家，极致的装备和成熟的战斗诀窍是成功的前提，由于该途径没有盟友支援，且失败没有重试机会。